Muy importante
Los gobiernos de la región consideraron la importancia de la preservación de este acuífero creando el "Proyecto Sistema Acuífero Guaraní".
El mayor riesgo de deterioro es el aumento de los volúmenes explotados y el crecimiento de las fuentes de polución.
La contaminación puede ser debida a diferentes factores:
a) Actividad humana:
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como la construcción de fosas sépticas
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la agricultura: componentes orgánicos, uso de pesticidas
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Industriales: pinturas, gasolina.
b) Factores naturales:
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por las capas freáticas demasiados ricas en sales disueltas o por la erosión natural de cientos de rocas.
El agua subterránea tiende a ser dulce y potable, debido a que la circulación subterránea tiende a depurar el agua de partículas y microorganismos contaminantes, obteniendo un agua de excelente calidad, siendo así un mecanismo natural de filtración y depuración.
La contaminación de estas aguas puede permanecer por largos períodos, debido a la baja renovación y el tiempo de residencia, ya que no se pueden aplicar procesos artificiales de depuración por su difícil acceso.
Esa calidad del agua y la posibilidad de captación en los propios locales donde ocurren las demandas, hacen que el aprovechamiento de las aguas del Acuífero Guaraní asuman características económicas, sociales y políticas destacadas para el abastecimiento de la población.